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精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖
來源:研之成理 時(shí)間:2020-04-09 15:10:41 瀏覽:19455次

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前言:

XRD是非常常用的表征手段,前面我們主要從它的用途,具體原理以及實(shí)際操作等幾個(gè)方面進(jìn)行了分享。今天我們將整個(gè)過程串起來,給大家一個(gè)直觀的認(rèn)識(shí),看看XRD如何一步一步從樣品到最后文章中的圖。



通過上一期的內(nèi)容(從樣品到原始數(shù)據(jù)),大家應(yīng)該大致了解如何通過多晶衍射儀得到XRD原始數(shù)據(jù)(包括rawtxt兩個(gè)文件)。今天就接著從這里開始分享,看看如何從這兩個(gè)原始文件最后變成可用于文章的圖。


1. 基于Jade的物相鑒定方法

簡單的利用Jade進(jìn)行物相分析的方法,我們在第二期已經(jīng)分享過了,今天咱們更進(jìn)一步,看看XRD如何分析復(fù)雜的物相,順便對Jade進(jìn)行較為全面的介紹。


Step 1. 采用jade來讀取raw文件:如下圖所示

打開Jade軟件,F(xiàn)ile-->Read,在彈出來的窗口中找到目標(biāo)文件所在文件夾,點(diǎn)擊選取目標(biāo)文件(raw文件),然后打開。


精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-1
友情提示:如果覺得看不清楚,可以點(diǎn)擊圖片,然后就可以方便的放大查看了。


打開之后,得到下圖所示界面:

精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-2


Step 2: 物相檢索匹配(search/match)

注:在有些教程中,也有說采用Jade自帶扣背景功能先扣除背景和刪除雜峰的。這里,小編不推薦,因?yàn)椴捎迷紨?shù)據(jù)進(jìn)行S/M得到的信息是最多的(請讀者根據(jù)實(shí)際情況進(jìn)行斟酌)

采用Jade的S/M功能大致可以分三步走:


A. 無條件自動(dòng)檢索,具體操作如下圖所示。


精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-3


點(diǎn)擊Jade軟件菜單中Identify-->Search/Match setup, 在彈出來的對話框中, 勾選上subfiles to search中需要的數(shù)據(jù)庫(一般至少選中Inorganic, Minerals, ICSD patterns以及ICSD minerals這四個(gè),其他的根據(jù)實(shí)際情況增加)

無條件自動(dòng)檢索中,不要勾選use Chemistry,直接點(diǎn)擊OK就行。


此時(shí)將會(huì)得到下圖所示界面:


精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-4

自動(dòng)匹配后,主要的物相往往能夠識(shí)別出來,以上圖為例,主要的物相為ZnO(識(shí)別結(jié)果中第一個(gè)即是,F(xiàn)OM值最小表面匹配度最好,從譜圖匹配的情況也可以看出對應(yīng)得很好)。但是,紅色框中的幾個(gè)峰并不能和ZnO吻合,表面含有其他物質(zhì),不是單一組成。


怎么辦呢?


B. 這就要用到第二種檢索方法,單峰檢索(或者特定峰檢索)


具體操作為:利用下圖所示“積分”工具,在想要檢索的峰下拉取基線。可以單選一個(gè)峰,也可以選多個(gè)峰(一般進(jìn)行單峰檢索)。選中該峰之后,再次點(diǎn)擊Search and Match,讓其自動(dòng)檢索。

精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-5


自動(dòng)檢索的結(jié)果,如下圖所示:

精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-6

自動(dòng)檢索的結(jié)果中,F(xiàn)OM值最?。ㄆヅ涠茸詈玫模┑臑锳g,但實(shí)際上我們這里真實(shí)的組成是Au。這也是給大家提個(gè)醒,不要迷信FOM值以及自動(dòng)匹配,Jade不是萬能的,不能夠區(qū)分很細(xì)小的差別。實(shí)際上Au和Ag在同一族,都是FCC結(jié)構(gòu),只是原子大小的差異,因此XRD衍射峰非常類似,差異性極小。


在完全不知道組成的情況下只通過Jade來斷定物質(zhì)的組成是武斷的,一定要跟其他表征結(jié)果結(jié)合起來。


當(dāng)然,實(shí)際上,更多的情況下,我們往往知道樣品中含有哪些元素,為了更加準(zhǔn)確地得到物相信息,Jade里面有一個(gè)非常有用的功能,就是限制元素組成,這是jade物相檢索的第三種方法——C. 限定條件的檢索。

這里依舊以剛才的Au那個(gè)峰為例,如果限制元素會(huì)得到怎樣的結(jié)果呢?



如何限定條件?還是剛才的Identify-->Search/Match setup,在彈出來的框中,不是有個(gè)Use Chemistry嗎?把它勾上就是限定條件了,那么限定的條件是什么呢?點(diǎn)擊Chemistry,在彈出的元素周期表中,點(diǎn)選上你想要的元素(綠色為一定含該元素,灰色為不含該元素,藍(lán)色為可能含有該元素。大家可以根據(jù)實(shí)際情況,靈活選用)


精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-7

這里,由于我們確定里面含有Au,想要確定Au的峰,因此點(diǎn)擊兩次Au元素將其變成綠色,然后點(diǎn)擊OK。匹配結(jié)果如下:

精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-8

我們可以看到,圖中的幾個(gè)峰與Au完全能夠匹配上,因此確定了整個(gè)物質(zhì)的組成為ZnO+Au。


當(dāng)然,這里只是舉個(gè)比較簡單的例子,在實(shí)際情況中可能有些情況會(huì)比較復(fù)雜。但是基本上,利用jade來進(jìn)行物相分析的方法就是以上三種,大家在實(shí)際操作中要靈活使用,特別是單峰檢索以及限定條件檢索。(如果大家遇到問題,可以在QQ群里面求助,相信群里面有很多大牛能夠解答大家的問題)


在完成檢索之后,大家還會(huì)用到的一個(gè)功能是,如何提取表征卡片的信息?

精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-9


雙擊Search and Match結(jié)果中所匹配上的PDF卡片,會(huì)彈出一個(gè)寬口,窗口中reference欄中標(biāo)記出了相應(yīng)的參考文獻(xiàn),點(diǎn)群等信息;而點(diǎn)擊line就可以得到標(biāo)準(zhǔn)卡片的信息值,包括2 theta, d值, hkl等,如上圖所示。而點(diǎn)擊export可以導(dǎo)出這個(gè)數(shù)據(jù)表。(主要看大家的實(shí)際需求)


以上為整個(gè)XRD的分析過程,希望能夠讓大家明白整個(gè)過程是怎么回事。


2. 基于origin的XRD數(shù)據(jù)作圖


Origin作圖我們前面已經(jīng)分享很多了,本來不需要多說,但是為了讓整個(gè)過程更加完整,這里補(bǔ)充一點(diǎn)內(nèi)容,著重強(qiáng)調(diào)圖中的一些注意點(diǎn)。


A. 數(shù)據(jù)導(dǎo)入(基于txt文件)以及做線性圖是origin中最基本的,前面已經(jīng)分享了,這里不多說。

精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-10


B. XRD譜圖格式

XRD定性分析中,縱坐標(biāo)衍射峰強(qiáng)度的數(shù)值不是特別重要,在譜圖中可以不顯示,相應(yīng)地其縱坐標(biāo)為Intensity (a.u.),請注意Intensity和(a.u.)之間需要有空格。而橫坐標(biāo)是非常重要的,要顯示數(shù)值且選擇的間距要合適,橫坐標(biāo)為2 theta (degree).


origin如何優(yōu)化譜圖可以參見:圖形美化之一。重點(diǎn)是:譜線與坐標(biāo)軸線條大?。?/span>一般為3,顯示四個(gè)邊框,除底邊外,其他軸均不含刻度),橫縱坐標(biāo)字體大小(一般為28, Arial, 粗體),譜線類型為B-spline。此外,要合理調(diào)整譜圖顯示范圍。具體如下圖所示:

精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-11


C. XRD譜圖中其他附加信息

有些情況下,人們?yōu)榱俗尨蠹腋忧逦鷺悠返奈锵嘟Y(jié)構(gòu),會(huì)對樣品的晶型結(jié)構(gòu)進(jìn)行標(biāo)注(有些情況下,大家會(huì)直接將hkl值標(biāo)記在峰上,這個(gè)視具體情況而定)。大家可以采用導(dǎo)出的PDF卡片,通過圖層的形式做到譜圖下面(直接顯示標(biāo)準(zhǔn)卡片的XRD譜圖或者采用豎線顯示特征峰位置)。簡單一點(diǎn)的,也可以直接采用符號(符號大小可以統(tǒng)一為12)標(biāo)記出各個(gè)峰的歸屬(請根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)卡片所示的2 theta值等進(jìn)行標(biāo)定),如下圖所示:

精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-12

精品干貨:XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-13



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全部 3小時(shí)前 四川
文字是人類用符號記錄表達(dá)信息以傳之久遠(yuǎn)的方式和工具?,F(xiàn)代文字大多是記錄語言的工具。人類往往先有口頭的語言后產(chǎn)生書面文字,很多小語種,有語言但沒有文字。文字的不同體現(xiàn)了國家和民族的書面表達(dá)的方式和思維不同。文字使人類進(jìn)入有歷史記錄的文明社會(huì)。
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