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TMT修飾組
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TMT修飾組
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TMT是一種基于等重同位素的標(biāo)記定量蛋白組學(xué)技術(shù),而TMT修飾組是將TMT與磷酸化/乙酰化修飾結(jié)合的翻譯后修飾組學(xué)。它借助于TMT標(biāo)記、分級的優(yōu)勢達(dá)到了在保證樣本間重復(fù)穩(wěn)定性的同時實現(xiàn)更高檢測深度的優(yōu)勢。
技術(shù)路線
技術(shù)優(yōu)勢
1. 同一批次標(biāo)記定量穩(wěn)定性高。
2. 通過分級方法可大大增加修飾位點的鑒定深度。
數(shù)據(jù)分析
1、標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容
鑒定分析:鑒定與定量結(jié)果統(tǒng)計;單個樣本蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計;韋恩圖。
表達(dá)差異分析:差異結(jié)果統(tǒng)計;差異結(jié)果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。
多組的比較分析(組別>=3):mufzz聚類;雷達(dá)圖;箱線圖。
功能分析:亞細(xì)胞定位;結(jié)構(gòu)域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡(luò)分析。
質(zhì)量控制分析:肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布。
2、高級數(shù)據(jù)分析
功能分析:GSEA富集分析。
臨床藥物研究:藥物靶點注釋。
標(biāo)志物篩選:集成機器學(xué)習(xí)。
與臨床表征的聯(lián)合分析:熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。
推薦組合產(chǎn)品
TMT+TMT磷酸化
TMT修飾組
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