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長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)

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長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)

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項(xiàng)目介紹

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類(lèi)轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過(guò)200 nt的RNA分子,它們不編碼蛋白。lncRNA的表達(dá)受到發(fā)育調(diào)控,是組織和細(xì)胞特異的。相當(dāng)一部分lncRNA只位于細(xì)胞核內(nèi)。它們包含許多類(lèi)型的轉(zhuǎn)錄本,在結(jié)構(gòu)上類(lèi)似mRNA,有時(shí)也轉(zhuǎn)錄成編碼基因的反義轉(zhuǎn)錄本。lncRNA被認(rèn)為執(zhí)行了重要的調(diào)控功能,也與疾病發(fā)展息息相關(guān)。

技術(shù)特點(diǎn)

 1. lncRNA在不同的發(fā)育階段lncRNA的表達(dá)水平不同

 2. 在不同的癌組織或其他疾病中,lncRNA差異性表達(dá)

 3. LncRNA的調(diào)控機(jī)制多元化、復(fù)雜性高,在細(xì)胞中存在數(shù)量是mRNA的3~100倍

技術(shù)流程

圖中深色為該技術(shù)流程

分析流程:

標(biāo)準(zhǔn)分析

(1) 數(shù)據(jù)過(guò)濾及比對(duì)分析

(2) 轉(zhuǎn)錄本拼接

高級(jí)分析

(3) LncRNA的篩選及分析

(4) 靶基因預(yù)測(cè)

(5) 差異基因GO/KEGG分析,推測(cè)突變基因富集在哪些代謝通路。

樣品要求

樣本要求:

RNA濃度≥20ng/ul 總量≥2ug    

細(xì)胞數(shù)≥5X106

項(xiàng)目案例

差異分析聚類(lèi)圖

靶基預(yù)測(cè)圖

學(xué)術(shù)文章

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)

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