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宏蛋白組分析

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項(xiàng)目介紹

宏蛋白組學(xué)是應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對微生物群落進(jìn)行研究的一項(xiàng)新技術(shù)，在特定的時間對微生物群落的所有蛋白質(zhì)的組成進(jìn)行大規(guī)模的鑒定。宏蛋白組能夠提供微生物在生態(tài)系統(tǒng)中的功能信息，它有望把微生物群落的遺傳和功能多樣性聯(lián)系起來，對于不同環(huán)境的宏蛋白組分析可以捕捉新的功能基因和代謝途徑、鑒定與特異性脅迫有關(guān)的蛋白，蛋白組學(xué)聯(lián)合宏基因組學(xué)數(shù)據(jù)可以更好的揭示環(huán)境群落分類多樣性、功能多樣性和生物過程。

分析方法

將非標(biāo)定量技術(shù)、高效液相色譜分級技術(shù)以及基于質(zhì)譜的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)等一系列前沿技術(shù)的有機(jī)結(jié)合，對樣本進(jìn)行定量宏蛋白質(zhì)組學(xué)的研究。為了分析樣本中的物種組成信息，我們使用Unipept軟件預(yù)測肽段對應(yīng)物種的分類（taxonomy）信息，物種相對豐度值為樣本中所有比對到該物種的peptides intensity總和占所有peptides intensity總和的比例。然后使用Krona 軟件對物種注釋結(jié)果進(jìn)行動態(tài)可視化展示。

樣品要求

詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

項(xiàng)目案例