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差異蛋白分析

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項(xiàng)目介紹

     在定量組學(xué)研究中,往往通過(guò)分析不同實(shí)驗(yàn)條件下的樣本在蛋白或修飾位點(diǎn)水平的表達(dá)變化情況來(lái)研究復(fù)雜的生物調(diào)控機(jī)制。采用合適的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析方法,對(duì)明顯變化的蛋白或修飾位點(diǎn)的準(zhǔn)確識(shí)別是后續(xù)分析的基礎(chǔ)。

分析方法

      在定量組學(xué)研究中,采用蛋白或修飾位點(diǎn)在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中的信號(hào)比值(Ratio)作為衡量其在兩種狀態(tài)下的表達(dá)量差異。為確保表達(dá)差異在統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著性,通過(guò)多次(三次或三次以上)重復(fù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果計(jì)算差異顯著性檢驗(yàn) T-test p value。當(dāng) Ratio 大于指定閾值且 p value 小于 0.05 時(shí)認(rèn)為蛋白或修飾位點(diǎn)是顯著差異的。

樣品要求

     在定量組學(xué)研究中,往往通過(guò)分析不同實(shí)驗(yàn)條件下的樣本在蛋白或修飾位點(diǎn)水平的表達(dá)變化情況來(lái)研究復(fù)雜的生物調(diào)控機(jī)制。采用合適的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析方法,對(duì)明顯變化的蛋白或修飾位點(diǎn)的準(zhǔn)確識(shí)別是后續(xù)分析的基礎(chǔ)。

分析方法

      在定量組學(xué)研究中,采用蛋白或修飾位點(diǎn)在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中的信號(hào)比值(Ratio)作為衡量其在兩種狀態(tài)下的表達(dá)量差異。為確保表達(dá)差異在統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著性,通過(guò)多次(三次或三次以上)重復(fù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果計(jì)算差異顯著性檢驗(yàn) T-test p value。當(dāng) Ratio 大于指定閾值且 p value 小于 0.05 時(shí)認(rèn)為蛋白或修飾位點(diǎn)是顯著差異的。


項(xiàng)目案例

不同比較組中差異蛋白個(gè)數(shù)分布柱形圖

差異表達(dá)蛋白火山圖

學(xué)術(shù)文章

差異蛋白分析

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